Όπως το έντερο και το πεπτικό, έτσι και η στοματική μας κοιλότητα χαρακτηρίζεται από το μικροβίωμά της, το οποίο περιλαμβάνει πάνω από 700 είδη βακτηρίων. Αυτά τα βακτηριακά είδη απαιτούν ένα σταθερό περιβάλλον για να επιβιώσουν, το οποίο εξαρτάται από τη φυσιολογική θερμοκρασία του σώματος 37 °C και την ισορροπημένη διατροφή. Αναλόγως, μάλιστα, με διαφορετικές επιφάνειες και στοματικούς υποδοχείς, συγκεκριμένα βακτήρια αποικίζουν σε συγκεκριμένες επιφάνειες (δόντια, ουρανίσκο, ούλα, γλώσσα, μάγουλα κ.ο.κ.)